A história se passa no século 23 onde a sociedade é composta por humanos geneticamente modificados e o que importa para todos é o DNA. O governo tem o total poder sobre a sociedade e o nascimento das pessoas. Há somente 1 homem para cada 9 mulheres, pois os homens são considerados de conduta potencialmente agressiva. Não existem parentesco e relações amorosas. Sentimentos como o amor e luxúria foram abolidos. Essas modificações genéticas visam melhorar algumas funções dos seres humanos, e de acordo com essas funções é feita uma classificação com nomes de cores. Os genes tem um peso maior do que o caráter da pessoa, e quase todo o seu futuro já está traçado. Cada indivíduo possui um tempo de vida de 45 anos e sua fase adulta é plena e saudável. No enredo, uma garota chamada Mika Seido que possui gene do tipo branco, ou seja, nasceu sem modificações, é recrutada como piloto e vai para uma estação espacial. Por ser branca sofre uma série de preconceitos. Durante a história, várias coisas acontecem como as relações entre os integrantes atuantes na nave Bilkis, as batalhas com o mecha Shaft, as ações de uma ameaça alienígena, conflitos de interesses entre agentes que combatem essa ameaça e situações que colocam em questão o modo de vida da sociedade do século 23.