Em Burst Angel mostra um Japão do Futuro, onde uma organização denominada RAPT, responsável pela paz de Tókio, domina a cidade. Nos subterrâneos, a organização cria monstros técno-orgânicos, tentando criar o ser perfeito “para garantir um futuro livre”. Kyohei é um simples estudante, que sonha em ir para a França. Para pagar a viagem, ele começa a trabalhar de cozinheiro para as garotas Meg, a mecânica; Jo, a atiradora prodígio; Amy, a especialista em computadores; e Sei, que trabalha para Bai Lan. Elas trabalham como mercenárias, e fazem de tudo por dinheiro. Elas descobrem a agenda secreta da RAPT, e muita confusão vem por aí…