A história se passa em Diamond Ore Country, da qual Diancie é a princesa.Este é um país localizado no subsolo, onde os Pokémon Carbink vivem juntos em paz. A fonte de energia deste país é um diamante gigante chamado Diamante Sagrado, que só pode ser criado pela princesa Diancie. No entanto, a princesa atual ainda não possui o poder de criar um diamante assim, e o poder do atual diamante sagrado se esgotará em breve, o que resultaria no fim do país. Diancie encontra Ash e Pikachu, e parte com eles para procurar o lendário Pokemon Xerneas, que possui poder sagrado, mas no caminho, eles encontram o casulo onde o Pokémon de Destruição, Yveltal, que supostamente havia destruído uma vez vida em Kalos, está à espera.