Sengoku Collection gira em torno de muitos samurais que são acidentalmente removidos a partir de um universo paralelo habitado por personagens históricos bem conhecidos. Ao contrário do período da guerra histórica conhecida por nós, todos os habitantes deste mundo único parecem com as meninas do ensino médio. Vindo da era medieval e encontrando-se totalmente espantado por tudo o que encontram no dia moderno de Tóquio, as meninas se tornam melhores amigos através de suas aventuras.