Já se passaram dois anos desde a Quarta Guerra Mundial Shinobi, e o mundo está mais uma vez existindo em harmonia - isto é, até que outra ameaça surja e mais uma vez coloque o planeta à beira da destruição. Em meio à catástrofe iminente, a irmã de Hinata Hyuuga, Hanabi, é subitamente seqüestrada. Naruto Uzumaki, junto com uma equipe de ninjas habilidosos; Sakura, Sai, Shikamaru e Hinata partiram para resgatar Hanabi das garras malignas de Toneri Ootsutsuki. Enquanto eles se aproximam cada vez mais de completar sua missão, eles se deparam com vários adversários, que não apenas testarão o relacionamento que têm um com o outro, mas também colocarão o destino do planeta diante da incerteza. Enquanto o relógio dispara, a equipe corre para terminar a última batalha, lutando pela paz ... e pelo amor.